XIV yüzyılın sonuna kadar Karakoyunlu adını taşıyan Türkmen boyları bayraklarında karakoyun figürü bulunması nedeniyle “Karakoyunlular” olarak adlandırılmışlardır. Karakoyunlu Türkmenleri, Van Gölü’nden, Anadolu’nun Batısı’na kadar olan bölgeyi ele geçirmiş, Sultan Hüseyin ile anlaşma yaparak Ermenistan ve Azerbaycan’ı içine alan bir hanedanlık kurmuşlardır.

Bu hanedanın ikinci hükümdarı Karayusuf birkaç defa Timur tarafından kovulmuş, ancak yine geri dönmeyi başarmıştır. Karayusuf, 1405 (807) yılında Timur’un ölümünden sonra önceden hakim olduğu bölgeleri geri almıştır. 1411 yılında ise Celayirlileri hakimiyet altına almıştır. 1469 (874) yılında Karakoyunlu Türkmenleri, Akkoyunlular’a tabi oldular. Akkoyunlu Türkmenleri’nin başında Uzun Hasan bulunuyordu.